À partir d’une observation participante de plus de trois ans, l’article propose d’analyser les déterminants et effets de la hiérarchisation des disciplines dans le contexte d’une grande université pluridisciplinaire française. Lieu essentiel d’octroi des postes et des ressources matérielles et symboliques, les universités ont été transformées par les financements Investissements d’avenir qui ont amplifié les inégalités entre les disciplines, sans avoir eu d’effet important sur leur consistance institutionnelle. L’article montre concrètement comment les sciences sociales et humaines se trouvent marginalisées dans les luttes pour définir l’ordre disciplinaire local, même si certaines disciplines parviennent à en tirer bénéfice. L’article montre aussi comment les indicateurs de pilotage contribuent à l’intériorisation des hiérarchies disciplinaires. Ces dynamiques, qui se combinent avec les appréciations différenciées du « sérieux » des étudiants dans les filières de formation, contribuent à masquer la dégradation des conditions de recherche et d’étude qui affectent en particulier les sciences sociales et humaines.