Hassan Hanafi comprend l’islam fondamentaliste comme une réaction historique à des circonstances particulières. Ainsi l’islam politique ne serait pas un choix mais le seul refuge qui soit disponible. C’est pourquoi, l’intellectuel égyptien appelle à une alternative post-fondamentaliste. L’islam post-fondamentaliste serait une vision progressiste, rationnelle, historique et humaine, basée sur les principes de la charia, et surtout endogène. C’est dans la création de cette alternative née dans son propre terreau que serait l’un des grands défis de l’intellectuel arabo-musulman.